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吉安市特殊教育学校的助学金申请流程一般包括以下几个步骤：首先，学生需要提交助学金的申请及相关证明材料。接着，学校会进行资格审核和评定。审核通过后，学校将名单上报至相关部门。最后，由教育部门或相关机构完成最终审批并划转资金。

关于发放时间，助学金通常在每年的学期初或学期末发放，以确保学生的学业和生活需求。具体的发放时间会根据当年的政策和流程而定，学生可咨询学校或相关部门了解详情。