瑞金中等专业学校在处理学生违纪行为时，会根据学校的相关规定和程序，结合学生的违纪情况进行公正、公平、公开的处理。对于严重违纪行为，学校会依据校规进行严肃处理，同时注重对学生进行思想教育引导，帮助学生认识到自己的错误，积极改正，重新回到正轨。在处理学生违纪行为时，学校也会充分尊重学生的权益和意见，与家长进行沟通协商，共同促进学生的成长和发展。