共青中医药学校毕业生升学的主要途径包括：

1. 高职院校自主招生：通过参加高职院校的自主招生，毕业生可以直接升入相关高职院校继续深造。

2. 统一高考：毕业生可以选择参加全国统一高考，根据自己的成绩报考不同层次的高校。

3. 成人高等教育：对于未能立即升学的毕业生，可以选择参加成人高考，进入成人高等教育学校学习。此外，还有其他途径如网络教育、自考等。毕业生可根据自身情况选择合适的升学途径。